Trả lời kiến nghị của Hiệp hội Doanh nghiệp Hàn Quốc, Cục Thuế cho biết, việc hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) phải được xem xét, căn cứ hồ sơ của từng doanh nghiệp theo đúng quy định pháp luật.

Ngày 1/7, Cục Thuế có Công văn số 4425/CT-CS gửi Hiệp hội Doanh nghiệp Hàn Quốc tại Việt Nam (KOCHAM), làm rõ nguyên tắc áp dụng thuế suất GTGT 0% đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ và việc xử lý hồ sơ hoàn thuế GTGT.

Công văn được ban hành sau khi Cục Thuế nhận các văn bản số 0414/KC-CT ngày 13/4/2026, 0416/KC-CT và 0416/KC-BTC cùng ngày 16/4/2026 của KOCHAM phản ánh, kiến nghị liên quan đến chính sách thuế GTGT đối với hoạt động xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ.

Về nguyên tắc áp dụng thuế suất GTGT 0%, Cục Thuế cho biết, hàng hóa xuất khẩu chỉ được áp dụng mức thuế suất này khi đáp ứng đầy đủ các điều kiện theo quy định của pháp luật, bao gồm hợp đồng bán hoặc gia công hàng hóa xuất khẩu, chứng từ thanh toán qua ngân hàng, tờ khai hải quan và các điều kiện khác theo quy định của pháp luật về thuế GTGT, hải quan và các quy định liên quan.

Đối với các giao dịch phát sinh trước ngày 1/7/2025, việc xác định hàng hóa mua bán giữa doanh nghiệp Việt Nam với tổ chức, cá nhân nước ngoài nhưng giao nhận tại Việt Nam có thuộc trường hợp xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ hay không phải căn cứ quy định pháp luật có hiệu lực tại thời điểm phát sinh giao dịch, trong đó có Luật Hải quan, Nghị định số 08/2015/NĐ-CP, Thông tư số 38/2015/TT-BTC đã được sửa đổi, bổ sung tại Thông tư số 39/2018/TT-BTC, Luật Quản lý Ngoại thương và các văn bản hướng dẫn liên quan.

Trường hợp cơ quan có thẩm quyền xác định tờ khai hải quan không phù hợp với quy định hoặc giao dịch không đáp ứng điều kiện áp dụng thuế suất GTGT 0% thì cơ quan Thuế không có cơ sở giải quyết hoàn thuế theo mức thuế suất này.

Cục Thuế cũng nhấn mạnh, từ ngày 1/7/2025, Luật số 90/2025/QH15 đã bổ sung Điều 47a vào Luật Hải quan, quy định về hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ là hàng hóa giao, nhận tại Việt Nam theo chỉ định của thương nhân nước ngoài theo hợp đồng mua bán, gia công, thuê, mượn giữa các doanh nghiệp Việt Nam với các thương nhân nước ngoài.

Đồng thời sửa đổi quy định của Luật thuế GTGT để bổ sung hàng hóa xuất khẩu tại chỗ thuộc đối tượng áp dụng thuế suất 0%.

Bên cạnh đó, Nghị định số 167/2025/NĐ-CP cũng đã sửa đổi, bổ sung Nghị định số 08/2015/NĐ-CP nhằm hướng dẫn thủ tục hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ.

Tuy nhiên, các quy định mới được áp dụng theo hiệu lực của văn bản pháp luật và không làm thay đổi nguyên tắc xử lý đối với các giao dịch đã phát sinh trước thời điểm có hiệu lực, trừ trường hợp pháp luật có quy định khác.

Đối với kiến nghị về xử lý hồ sơ hoàn thuế GTGT, Cục Thuế khẳng định, thẩm quyền quyết định hoàn thuế được thực hiện theo quy định của pháp luật về quản lý thuế.

Theo đó, cơ quan Thuế quản lý trực tiếp người nộp thuế có trách nhiệm tiếp nhận, kiểm tra hồ sơ, đối chiếu điều kiện áp dụng thuế suất GTGT 0% và quyết định hoàn thuế đối với từng hồ sơ cụ thể.

Các văn bản của KOCHAM chủ yếu nêu kiến nghị chính sách và tổng hợp số liệu về số thuế GTGT dự kiến bị ảnh hưởng, chưa kèm theo hồ sơ cụ thể của từng doanh nghiệp. Vì vậy, Cục Thuế chưa có cơ sở để kết luận chung về việc áp dụng thuế suất GTGT 0% hoặc xử lý hoàn thuế đối với toàn bộ các trường hợp được KOCHAM nêu.

Đối với từng doanh nghiệp hội viên, nếu hồ sơ chứng minh hàng hóa đáp ứng đầy đủ điều kiện được coi là hàng hóa xuất khẩu, đủ điều kiện áp dụng thuế suất GTGT 0% và hoàn thuế theo quy định có hiệu lực tại thời điểm phát sinh giao dịch, thì cơ quan Thuế quản lý trực tiếp sẽ xem xét, giải quyết theo đúng thẩm quyền.

Trường hợp cần xác minh tính hợp lệ của tờ khai hải quan, tình trạng hàng hóa đưa vào kho ngoại quan hoặc các nội dung liên quan đến thủ tục hải quan, cơ quan thuế sẽ phối hợp với cơ quan hải quan nơi đăng ký tờ khai để xử lý theo quy định.

Đối với những trường hợp đã có quyết định xử lý của cơ quan có thẩm quyền, việc xem xét tiếp theo (nếu có) sẽ được thực hiện theo trình tự, thủ tục của pháp luật về quản lý thuế, khiếu nại và các quy định pháp luật có liên quan.

Thời gian qua, Tổng cục Thuế (nay là Cục Thuế) đã ban hành nhiều văn bản hướng dẫn cơ quan thuế địa phương về chính sách thuế GTGT đối với hoạt động xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ, trong đó có Công văn số 558/TCT-CS ngày 20/2/2024.

Đồng thời, Cục Hải quan cũng đã có Công văn số 4694/TCHQ-GSQL ngày 1/10/2024 hướng dẫn việc xác định thương nhân nước ngoài không có hiện diện tại Việt Nam và cơ chế phối hợp giữa cơ quan Hải quan với cơ quan Thuế trong xác minh tính hợp lệ của tờ khai hải quan.

Trên cơ sở đó, Cục Thuế đề nghị KOCHAM thông báo tới các doanh nghiệp hội viên chủ động liên hệ với cơ quan thuế quản lý trực tiếp, cung cấp đầy đủ hồ sơ, tài liệu liên quan đến từng giao dịch và từng kỳ hoàn thuế để được xem xét, giải quyết theo đúng quy định.

Đối với các vướng mắc vượt thẩm quyền, cơ quan thuế địa phương sẽ tổng hợp, báo cáo Cục Thuế để được hướng dẫn hoặc phối hợp với các đơn vị thuộc Bộ Tài chính xử lý.

Nguồn: Tạp chí Kinh tế - Tài chính